进入车间内的管道除了按工业管道的施工要求进行除锈、脱脂、防腐等处理外，管道表面要擦拭，管口要及时进行封堵，管道尽量在洁净室外预制，减少洁净室内施工量，分段预制组装好的管道两端应用塑料布或盲板封闭。管线的布置排列紧凑且同时考虑管道的拆洗、消毒、维修等生产要求。
净化车间施工前提是合理的设计，一套的净化车间施工方案能够让团队操作变得更加有效率。
对于净化车间施工流程中的风管制作要求严格，一般在相对密闭的室内进行，墙面需光滑，实验室车间，不易产生灰尘，地面铺设需是加厚地板，无尘无污染。净化车间施工流程中，人员的进出以及制作过程中穿戴的服饰以及鞋帽，需保持干净，无灰尘。
在净化车间施工流程的制作风管期间，采用的制作工具需用酒精进行擦拭消毒。风管的制作需认真仔细，对于规格不同的风管需采取整板制作，尽可能的减少加强筋，以便更快的投入使用中。
百级无尘室建筑方式可分为土建结构和装配式两种，SC车间，其中普遍采用装配式。装配式百级无尘室洁净系统主要由静压箱，包装车间，过滤器，铝合金扩散板，淮北车间，标准法兰接口等组成，造型美观，结构简单，使用可靠。 如送风口为下装式，具有在洁净室内安装和更换过滤器方便的优点，过滤器采用机械压紧或液槽密封装置，确保风口安装无泄露，密封可靠，净化效果好.动力及照明系统；工作环境参数的监测报警消防和通讯系统；物流系统；工艺管路系统。
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